初始系徽

• 設計者：
  高雄醫學大學 運動醫學系92級 韓逸成
• 設計概念：
  本學系的系徽根據學系成立的宗旨-將運動更科學性地融入醫學領域-為主體；全圖代表著『運動醫學系』強勁的延展力。
  頂端長著天使翅膀的蛇杖，象徵著神秘的生命力，代表著運動醫學技術隨著現代科學騰飛；以紅色與藍色對比呈現的運動員，象徵著動脈與靜脈間的循環不息，傳達本系師生不斷超越與前進的發展潛能。兩側的V形橄欖葉不僅歌頌著運動員勝利之意，更可預見『運動醫學系』美好的未來。
  註：古代奧林匹克運動會獎給勝利者野橄欖葉編織成的花冠，表示勝利之意。
  
  

2023新款系徽

• 設計者：
  高雄醫學大學運動醫學系92級 韓逸成
  高雄醫學大學運動醫學系92級 鄒亞璇